Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCAP28676 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCAP28676 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCAP28676 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCAP28676 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCAP28676 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCAP28676 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCAP28676 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCAP28676 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCAP28676 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCAP28676 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCAP28676 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCAP28676 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCAP28676 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCAP28676 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCAP28676 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCAP28676 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCAP28676 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCAP28676 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCAP28676 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCAP28676 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCAP28676 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCAP28676 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCAP28676 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCAP28676 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCAP28676 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCAP28676 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCAP28676 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCAP28676 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCAP28676 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCAP28676 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCAP28676 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCAP28676 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCAP28676 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCAP28676 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCAP28676 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCAP28676 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCAP28676 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCAP28676 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCAP28676 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCAP28676 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCAP28676 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCAP28676 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCAP28676 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCAP28676 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCAP28676 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms