Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6aP27664 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6aP27664 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms