Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSHP23434 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSHP23434 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSHP23434 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCSHP23434 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCSHP23434 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCSHP23434 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCSHP23434 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCSHP23434 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCSHP23434 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCSHP23434 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCSHP23434 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCSHP23434 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCSHP23434 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms