Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBG1P23258 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms