Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT1P21579 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT1P21579 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT1P21579 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT1P21579 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT1P21579 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT1P21579 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT1P21579 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT1P21579 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT1P21579 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT1P21579 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT1P21579 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT1P21579 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT1P21579 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT1P21579 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT1P21579 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT1P21579 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT1P21579 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT1P21579 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT1P21579 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT1P21579 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT1P21579 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT1P21579 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT1P21579 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT1P21579 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT1P21579 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT1P21579 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT1P21579 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT1P21579 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT1P21579 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT1P21579 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT1P21579 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT1P21579 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT1P21579 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT1P21579 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT1P21579 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT1P21579 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT1P21579 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT1P21579 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYT1P21579 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYT1P21579 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT1P21579 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT1P21579 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT1P21579 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT1P21579 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT1P21579 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT1P21579 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT1P21579 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT1P21579 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT1P21579 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT1P21579 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT1P21579 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT1P21579 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT1P21579 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT1P21579 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT1P21579 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT1P21579 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms