Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms