Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SDSP20132 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SDSP20132 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SDSP20132 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SDSP20132 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SDSP20132 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SDSP20132 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDSP20132 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDSP20132 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDSP20132 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDSP20132 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDSP20132 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDSP20132 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDSP20132 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDSP20132 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDSP20132 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDSP20132 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDSP20132 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDSP20132 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDSP20132 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SDSP20132 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDSP20132 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDSP20132 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDSP20132 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDSP20132 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDSP20132 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDSP20132 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SDSP20132 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDSP20132 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDSP20132 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDSP20132 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDSP20132 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDSP20132 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDSP20132 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SDSP20132 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDSP20132 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SDSP20132 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDSP20132 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDSP20132 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDSP20132 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDSP20132 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDSP20132 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDSP20132 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDSP20132 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDSP20132 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SDSP20132 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDSP20132 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDSP20132 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDSP20132 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDSP20132 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDSP20132 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDSP20132 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDSP20132 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDSP20132 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDSP20132 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms