Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIP12755 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIP12755 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIP12755 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIP12755 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIP12755 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIP12755 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIP12755 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIP12755 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKIP12755 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIP12755 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIP12755 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIP12755 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIP12755 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIP12755 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIP12755 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIP12755 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIP12755 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIP12755 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIP12755 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIP12755 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIP12755 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIP12755 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIP12755 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIP12755 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIP12755 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIP12755 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIP12755 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIP12755 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIP12755 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIP12755 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIP12755 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIP12755 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIP12755 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIP12755 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIP12755 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIP12755 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIP12755 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIP12755 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIP12755 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIP12755 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIP12755 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKIP12755 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKIP12755 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIP12755 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIP12755 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIP12755 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIP12755 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIP12755 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms