Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM200BP0CF97 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms