Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHAP00338 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHAP00338 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHAP00338 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHAP00338 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHAP00338 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHAP00338 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHAP00338 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHAP00338 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHAP00338 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHAP00338 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHAP00338 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHAP00338 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHAP00338 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHAP00338 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHAP00338 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHAP00338 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHAP00338 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHAP00338 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHAP00338 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHAP00338 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHAP00338 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHAP00338 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHAP00338 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHAP00338 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHAP00338 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHAP00338 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHAP00338 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHAP00338 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHAP00338 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHAP00338 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHAP00338 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHAP00338 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHAP00338 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHAP00338 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHAP00338 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHAP00338 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHAP00338 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHAP00338 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHAP00338 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDHAP00338 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHAP00338 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHAP00338 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHAP00338 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHAP00338 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHAP00338 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHAP00338 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHAP00338 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHAP00338 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDHAP00338 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDHAP00338 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDHAP00338 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDHAP00338 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDHAP00338 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDHAP00338 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDHAP00338 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms