Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms