Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sigmar1O55242 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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