Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSTPIP1O43586 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSTPIP1O43586 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms