Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC11O43248 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC11O43248 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms