Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNN4O15554 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNN4O15554 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNN4O15554 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNN4O15554 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNN4O15554 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN4O15554 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms