Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP2O00295 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP2O00295 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP2O00295 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP2O00295 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP2O00295 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP2O00295 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP2O00295 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP2O00295 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP2O00295 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP2O00295 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP2O00295 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP2O00295 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP2O00295 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP2O00295 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP2O00295 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP2O00295 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP2O00295 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP2O00295 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP2O00295 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP2O00295 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP2O00295 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP2O00295 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP2O00295 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP2O00295 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP2O00295 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP2O00295 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP2O00295 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP2O00295 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP2O00295 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP2O00295 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP2O00295 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP2O00295 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP2O00295 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms