Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
I3L4J1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
I3L4J1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
I3L4J1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
I3L4J1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
I3L4J1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
I3L4J1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
I3L4J1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
I3L4J1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
I3L4J1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
I3L4J1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
I3L4J1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
I3L4J1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
I3L4J1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
I3L4J1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
I3L4J1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
I3L4J1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
I3L4J1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
I3L4J1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
I3L4J1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
I3L4J1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
I3L4J1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
I3L4J1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
I3L4J1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
I3L4J1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
I3L4J1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
I3L4J1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
I3L4J1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
I3L4J1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
I3L4J1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
I3L4J1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
I3L4J1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
I3L4J1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
I3L4J1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
I3L4J1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
I3L4J1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
I3L4J1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
I3L4J1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
I3L4J1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
I3L4J1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
I3L4J1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
I3L4J1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
I3L4J1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
I3L4J1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
I3L4J1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
I3L4J1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
I3L4J1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
I3L4J1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
I3L4J1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
I3L4J1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
I3L4J1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
I3L4J1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
I3L4J1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
I3L4J1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
I3L4J1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
I3L4J1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
I3L4J1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
I3L4J1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
I3L4J1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
I3L4J1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
I3L4J1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
I3L4J1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
I3L4J1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
I3L4J1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
I3L4J1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
I3L4J1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
I3L4J1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
I3L4J1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
I3L4J1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
I3L4J1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
I3L4J1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
I3L4J1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
I3L4J1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
I3L4J1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms