Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms