Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms