Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931406B18RikA2RSL7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931406B18RikA2RSL7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms