Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samt1A2BED8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms