Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs4Q9Z1T2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms