Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms