Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USH1CQ9Y6N9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USH1CQ9Y6N9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms