Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USP16Q9Y5T5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP16Q9Y5T5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms