Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHB2Q9Y5E7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms