Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2J1Q9Y385 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms