Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax2Q9WTP9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms