Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms