Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms