Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms