Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFDP1Q9UEE9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms