Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms