Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms