Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM7SF3Q9NS93 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM7SF3Q9NS93 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM7SF3Q9NS93 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms