Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CENPJQ9HC77 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPJQ9HC77 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms