Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS7BQ9H9Q2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7BQ9H9Q2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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