Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP3Q9H6T3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms