Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms