Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms