Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms