Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP44Q9H0E7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms