Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM62Q9BVG3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms