Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms