Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHCHD7Q9BUK0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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