Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms