Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREX2Q9BQ50 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREX2Q9BQ50 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREX2Q9BQ50 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms