Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD5Q99717 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD5Q99717 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms