Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2Q96Q42 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms