Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX27Q96L92 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms